基于病毒基因保守序列的RT-PCR检测方法,是呼吸道病毒检测的常用方法,本次新冠病毒检测也同样适用。该方法通过对病毒RNA进行提取、逆转录、PCR扩增病毒保守序列(RdRP基因(特异性靶点)、E蛋白基因、N蛋白基因以及一个鉴定保守基因S区位点;可以只检测RdRP基因或者选择RdRP基因和其他多个基因确认),扩增体系中的荧光蛋白会结合扩增出的双链DNA序列从而发出荧光,根据检测到的荧光值判断是否有病毒存在并定量。
该方法的优点是相较于其他抗原抗体法(如胶体金技术)更为灵敏,检测结果更为准确,但是检测需要专业的仪器和分子检测实验室以及专业的操作人员,操作不当或者实验室条件不足可能会因气溶胶污染造成假阳性,且整个流程需要几个小时,相较于胶体金法时间更长。
CRISPR系统由向导RNA(gRNA)和Cas蛋白组成,gRNA能够指导Cas识别并切割带有特异序列的RNA或者DNA分子。其中Cas13a蛋白在特异性切割靶标RNA时,会继续切割非靶标RNA,利用这一特点,在整个体系中加入带有荧光标记的RNA信号分子,一旦带有荧光的RNA被切开,就会发出荧光信号,该技术与等温扩增技术结合,可高特异性高灵敏性低对病毒核酸进行检测。该技术检测时间相较于RT-PCR短,但是CRISPR系统研究出现时间较短,该系统存在有脱靶的可能,其灵敏度和特异性还有待考证。
逆转录环介导等温扩增法(RT-LAMP)对2009年H1N1大流行病毒的敏感性为97.8%,特异性为100%。基于LAMP的检测方法也被用于检测高致病性的H5N1和H7N9禽流感病毒,其敏感性比基于RT-PCR的方法具有可比性或更高的灵敏度。二、
病毒培养是诊断流感病毒感染的传统方法之一,但是传统的分离鉴定方法需要连续培养多天,敏感性和特异性都会低于核酸检测方法,虽然在前期确定侵害性病原物起到关键作用,但较为耗时,且不便捷,不能满足大量疑似患者筛查需求。
将免疫学方法(抗原抗体特异结合)与荧光标记技术结合起来研究特异蛋白抗原在细胞内分布的方法。由于荧光素所发的荧光可在荧光显微镜下检出,从而可对抗原进行细胞定位,这种检测方法的敏感性低于核酸检测方法。
胶体金是一种常用的标记技术,是蛋白质等高分子被吸附到胶体金颗粒表面的包被,是以胶体金作为示踪标志物应用于抗原抗体的一种新型的免疫标记技术。用于检测病毒使用的试剂条包被的是免疫系统中出现的该病毒特异性抗体或者是检测病毒本身的抗原,检测结果会出现肉眼可见的红色或者粉色条带。
虽然免疫胶体金层析技术操作简单,出结果快(一般为20分钟),但是此方法敏感性较差,加入样本后的原理靠的是层析,也就是往外分散,如果材料等质量有误差,会影响检测结果;也会因为病人感染时间较短或者采样部位导致病毒含量较低,导致出现假阴性。另外,该方法由于依赖抗原抗体,对于前期开发时选择包被的抗原/抗体最为关键,短时间内开发出的产品有待确认其特异性和灵敏性。
基因芯片技术、酶联免疫吸附测定(ELISA),IgG及IgM免疫荧光检测。在本次疫情中,通过临床特征和各项指标的判断,以及核酸检测来最终确诊是否为新冠病毒感染,其中CT影像和核酸检测一直作为诊断标准在疫情诊断中发挥着重要作用。从目前来看,不同检测方法均存在着各自的优势和弊端,只有综合运用各种检测工具,才能实现快速高效的检测,缩短新冠患者的确诊周期。
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